در دوران خشونت‌آمیز به نام باکوماتسو، یک قاتل ایشین وجود داشت که فقط به نام هیتوکیری باتوسایی شناخته می‌شد، که مهارت و بی‌رحمی‌اش در عصر بازسازی که او در ساخت آن کمک کرد، تقریباً افسانه‌ای شد. با این حال، با نزدیک شدن به زمان جنگ، او بدون هیچ اثری ناپدید شد، اما یازده سال بعد به عنوان یک شمشیرزن سرگردان، هیمورا کنشین، دوباره ظاهر شد.

روزی ، نوبیتا نوبی خرسی قدیمی پیدا میکند که مادربزرگش به او هدیه کرده بود. نوبیتا تصمیم می گیرد برای دیدار با مادربزرگش به گذشته برگردد. نوبیتا ...