دکتر رابرت نویل یک واکسن آزمایشی ساخته است که او را به تنها بازمانده مصون از یک فاجعه بیولوژیکی تبدیل می کند. گروهی از جهش یافته های قاتل علم را مقصر وضعیت خود می دانند و تلاش می کنند او را بکشند.

چهار لاک پشت نینجا جهش یافته نوجوان از سایه ها بیرون می آیند تا از شهر نیویورک در برابر یک باند نینجاهای جنایتکار محافظت کنند.