داستان گروهی از دانشمندان ماجراجو که آزمایشاتی روی فضا و زمان انجام می‎دهند. اما در حین این آزمایشات عجیب و غریب تغییراتی را در جهان ایجاد می‎کنند که عواقب بد زیادی را در پی دارد.

سازمان مونارک با نبردی سهمگین میان هیولایان غول‌پیکر مواجه می‌شود، از جمله گودزیلای قدرتمند که با ماترا، رودان و دشمن نهایی‌اش شاه گیدورای سه‌سر دست و پنجه نرم می‌کند...

هنگامی که خلبان نیروی هوایی سلطنتی، ستوان کیت سینکلر بر فراز افغانستان سرنگون می شود، در پناهگاه زیرزمینی متروکه ای پناه می گیرد که در آن سلاح های بیولوژیکی مرگبار ساخته دست بشر - نیمی انسان، نیمی بیگانه - بیدار می شوند.